Принадлежность: 
Описание организации: Корень АНБУ скрытого Листа создан с целью противодействия врагам оставаясь в тени деревни. Члены Корня ведут борьбу как с внутренними, так и с внешними врагами, при этом особая секретность и таинственность организации не дает нанести Корню ответный удар. Методы организации порой слишком грязны и аморальны, тем не менее направлены на процветание Конохи. Не смотря на то, что члены Корня служат на благо деревни, подчиняются они только своему лидеру.
Подчиняются: Шимуре Кенджи, капитанам.
Структура: как и в АНБУ, внутри Корня тоже есть свои капитаны - ниндзя достигшие большого авторитета и командующие всеми остальными нижестоящими членами Корня. После капитанов по старшинству идет глава Корня, чьим приказам подчиняются все. В основном в Корень набирают и тренируют ниндзя с малых лет, из разных кланов с которыми у лидера Корня существуют соглашения. Однако некоторых ниндзя могут завербовать в особом порядке.
Род занятий: внедрение во вражеские селения с целью добычи различной информации, добыча сведений о вражеских ниндзя и их силе, устранение вражеских ниндзя и нукенинов, шпионаж внутри вражеской деревни, ловля вражеских шпионов в своей деревне, устранение не лояльных скрытому Листу ниндзя, или тех в чьей лояльности сомневается лидер организации, защита и наблюдение за особыми активами деревни (джинчурики)
Секретность: о существовании Корня знают лишь избранный круг высокопоставленных лиц скрытого Листа, о местонахождении "штаб-квартиры" знает еще меньшее количество людей. Члены корня постоянно пользуются кодовыми или поддельными именами, причем на каждой новой миссии может быть придумано новое имя или личность. Для некоторых миссий по внедрению, где требуется принять на себя новую личность, члены корня могут пользоваться специальными техниками меняющее лицо. Зачастую, члены Корня так же носят маски, аналогичные АНБУ, дабы мимикрировать под них для обычных шиноби и населения деревни. Только близкие родственники в курсе, что их родственники служат в АНБУ, но они не знают, что в особенном. Сами члены Корня не могут передавать информацию каким-либо образом, ни об организации, ни о ее деятельности, ни о ее лидере.
Униформа и снаряжение: внутри деревни члены Корня часто мимикрируют под АНБУ, нося похожие звероподобные маски и плащи. В других ситуациях они вольны сами выбирать себе одежду, за тем исключением, что все его члены носят короткую чёрную куртку с поясом, с красными ремнями на плечах.
Выход из организации: невозможен. В связи с большим количеством тайн внутри организации и ее помешанности на сохранение секретности из Корня можно выйти только с помощью силы. Тем самым став нукенином и будучи подвергнутым охоте на свою голову.
Занятость: полная. Выполнение миссий только внутри организации.
Сюжетные требования: персонаж не ограничен рангом требуемым для вступления в Корень. Подходы в вербовке индивидуальны.
Технические требования: отсутствуют
Ограничения на игру: члены АНБУ выполняют миссии только указанного выше характера, и не могут выполнять миссии с обычными ниндзя или же членами других организаций. За редкими исключениями возможно выполнение миссий с особыми ниндзя Листа, которым требуется защита или за ними назначена слежка.
Бонусы: за каждые 2 выполненные миссии В ранги или выше, персонаж получает 15 ОП и 15000 ре.
Техники: -
Члены организации/отряда: